該所系統(tǒng)與進(jìn)化植物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室洪德元院士領(lǐng)銜的研究團(tuán)隊(duì)通過比較分解葉綠體基因組，揭開了花王牡丹的身世之謎—原來牡丹的傳統(tǒng)品種共搜集了我國中原地區(qū)5個野生品種的遺傳資本。

自20世紀(jì)90年月起，植物所重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室的牡丹、芍藥研究團(tuán)隊(duì)就開始調(diào)查牡丹植物資本?？蒲腥藛T通過普遍的野外觀測、居群取樣和統(tǒng)計(jì)分解，確認(rèn)牡丹有9個野生品種，分布于從西藏東南至中原的地區(qū)，為中國所特有。研究人員利用基因符號，重修了9個野生種牡丹的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系，同時還通過比較分解葉綠體基因組，找出了14個高分辨率的葉綠體基因。

科研人員又隨機(jī)選取47個牡丹傳統(tǒng)品種舉行分解，效果發(fā)現(xiàn)，這些傳統(tǒng)品種源自我國中原地區(qū)的5個野生種之間的雜交。據(jù)宋代“洛陽牡丹譜”紀(jì)錄的花王牡丹形成的人文線索，棲身在中原地區(qū)的祖先喜歡牡丹，把周圍不同的牡丹野生種引入庭院種植，為這些品種締造了自然雜交的時機(jī)，導(dǎo)致種間遺傳整合，使后裔牡丹的花色、花形千變?nèi)f化。

這一研究不僅揭開傳統(tǒng)牡丹品種來源之謎，同時也進(jìn)一步注釋了花王牡丹云云姹紫嫣紅的緣故原因。