番木瓜一般用種子繁殖，要使種子繁殖出的苗結(jié)實(shí)，不出現(xiàn)不效果的植株，在留種上應(yīng)把好幾個(gè)關(guān)。

一是選擇優(yōu)良的群體。優(yōu)良群體是指在整個(gè)果園中，番木瓜的各個(gè)植株品種、高矮、花的性別和果的形狀比較穩(wěn)定，雄型兩性株也即開雄型兩性花的植株較少，沒有雄株即開雄花不效果的植株，沒有花葉病植株或病株很少。如果發(fā)現(xiàn)有雄株，必須實(shí)時(shí)砍掉。發(fā)現(xiàn)有花葉病植株應(yīng)馬上砍掉并銷毀，防止花葉病傳到其他的植株上。

二是選擇優(yōu)良的植株，也就是選擇生長結(jié)實(shí)、抗病性強(qiáng)的植株，而且要耐濕、抗旱的植株。植株的節(jié)密，每片葉的葉腋都有開花，開花效果早，果實(shí)成熟早，果大，味甜。

三是在選擇優(yōu)良群體和優(yōu)良單株的基礎(chǔ)上，還要注重選擇單株上的優(yōu)質(zhì)果來采集種子。果實(shí)發(fā)育必須正常，果形正直，不能采畸形果，也不能采沒有成熟的果，或者是在樹上未轉(zhuǎn)黃而采下來后催熟或后熟的果。采果的較適時(shí)機(jī)是果實(shí)有三分之二以上釀成黃色，采后放1－2天再取出種子。

較后一個(gè)環(huán)節(jié)是種子取出以后，堆漚4－6天，目的是使包在種子外面的一層假種皮腐爛，洗清潔后漂去不充分的種子，去除白色未成熟的種子，晾干即可以播種。